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摘要
缩写词
第一章 前言
1 蛋白质的相互作用
1.1 蛋白与配体的相互作用机理
1.2 蛋白相互作用的影响因素
2 蛋白质相互作用中的抗原与抗体识别
2.1 抗原表位与抗体亲和力成熟
2.2 抗原抗体相互作用研究方法
3 抗原与抗体相互作用的分子模拟方法
3.1 蛋白相互作用中的分子模拟
3.2 分子模拟可靠性的关键因素
3.3 分子模拟技术介绍
3.4 虚拟氨基酸突变计算自由能
4 本论文研究内容,目的与意义
第二章 材料与方法
1 材料
1.1 主要仪器
1.2 主要试剂与材料
1.3 工作站和软件
1.4 常用溶液及试剂配制
2 方法
2.1 突变法鉴定抗原表位
2.2 抗原抗体结合活性分析方法
2.3 单抗与五聚体结合比例研究
2.4 蛋白质同源模建与分子对接
2.5 虚拟氨基酸突变
2.6 分子动力学模拟
第三章 结果与分析
第一部分 基于氨基酸虚拟突变的关键表位预测
1 基于晶体结构的交界面关键表位预测以及临界值的提出
2 基于分子模拟结构的交界面关键表位预测
3 基于小分子体系的交界面关键位点预澍
4 第一部分小结
第二部分 氨基酸虚拟突变在抗体亲和力成熟方面的应用
1 虚拟氨基酸突变
2 分子动力学模拟分析
3 第二部分小结
讨论
1 能量变化临界值的意义
2 虚拟饱和突变的应用价值
3 虚拟氨基酸突变的假阴性现象
4 分子模拟技术的发展
小结与展望
参考文献
致谢
在校期间发表成果
厦门大学;