含质粒人两歧双歧杆菌的分离、质粒测序和生物信息学分析

摘要

双歧杆菌(Bifidobacteria)是人和动物肠道内的主要生理菌之一，由于它具有抑制有害菌、免疫赋活、抑癌和营养等多种生物学功效，双歧杆菌已经广泛应用于食品和保健品生产，对它的研究早己成为微生态学界和食品学界的热点，但是现有的生产菌株携带天然质粒的情况却很少见。因此，对生产菌株进行基因水平的改造显得力不从心。如果能够分离到携带天然质粒的双歧杆菌株，通过分子生物学手段对它进行基因工程改造，使双歧杆菌制品增加新的抗感染、抗肿瘤功能，或将它改造成基因治疗的给药系统等，将使双歧杆菌方面的研究和应用升华到一个新的层次。　　本研究从健康男性青年粪便中分离到一株携带天然质粒的人两歧双歧杆菌株，在此基础上开展了以下几方面的研究工作：　　第一部分分离和鉴定携带天然质粒的双歧杆菌种株；第二部分测定双歧杆菌质粒pBIF10的提取和序列；第三部分分析pBIF10序列的生物信息学。

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符号说明

前言

第一章菌种的分离与鉴定

1材料与方法

1.1材料

1.2实验方法

2实验结果

3 讨论

4.结论

参考文献

第二章两歧双歧杆菌M203049的安全性鉴定

1材料与方法

1.1材料

1.2方法

2结果

3讨论

4结论

参考文献

第三章双歧杆菌天然质粒的分离、纯化和鉴定

1料与方法

1.1材料

1.2方法

2实验结果

3讨论

4结论

参考文献

第四章 质粒DNA的序列测定

1料与方法

2结果与讨论

3讨论

4结论

参考文献

第五章PBIF10 DNA序列的生物信息学分析

1材料与方法

2结果与讨论

3结论

参考文献

第六章PBIF10编码的蛋白质聚类分析

1材料与方法

2结果与讨论

2.1 pBIF10编码的5种蛋白质的聚类分析1

2.1 pBIF10编码的5种蛋白质的聚类分析2

2.2 pBIF10编码的5种蛋白质的基序分析

3.结论

参考文献

第七章几个重要蛋白质的二、三级结构预测

1材料与方法

2结果与讨论

2.1二级结构预测

2.2 3D结构的比较建模

2.3蛋白质二、三级结构预测的区别

3结论

参考文献

全文总结

综述：双歧杆菌的分子生物学研究进展

1双歧杆菌的微生态生理作用

2双歧杆菌的表面分子

3双歧杆菌基因工程研究

4双歧杆菌的分类鉴定

参考文献

致谢

读博士期间获得的课题、专利、成果和发表的论文