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代谢组学技术在代谢性疾病及氨基酸检测方面的应用

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第一部分 非肥胖人群中非酒精性脂肪性肝病的血清代谢组学研究

前言

1材料与方法

2结果

3讨论

4结语

参考文献

第二部分GC-MS衍生化法检测生物样本中的非极性氨基酸

前言

1材料与方法

2结果

3讨论

参考文献

文献综述:非酒精性脂肪性肝病的代谢组学研究进展

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摘要

背景:代谢组学(metabolomics)作为系统生物学的一个分支,能够用于分析生物体内的内外源性的代谢产物的变化,近年来屡被用于发现疾病代谢通路的改变,寻找诊断疾病的标志物,揭示研究对象所处的生理和病理状态。相关代谢组学技术,例如气相色谱、液相色谱或色质联用方法等,也常用于氨基酸、脂质等小分子物质的检测。近年来,非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver, NAFLD)在世界各国的发病率不断提高。虽然该病常合并肥胖、2型糖尿病等代谢综合征,但是值得注意的是,该病在非肥胖人群中也有较高的发病率。此病的发病机制尚不十分明确,各种诊断手段都有其弊端,且无有效的治疗药物。因此,寻找该病的诊断标志物,分析代谢通路的改变,探讨其发病机制,具有十分重要的意义。
  目的:⑴基于超高效液相色谱串联四级杆飞行时间质谱(Ultra performance liquid chromatography quadrupole time-of-flight mass spectrometry, UPLC-Q-TOF-MS)研究平台,利用非肥胖的NAFLD患者和年龄、体重指数(Body mass index, BMI)相匹配的健康对照人群的血清,进行非靶标的代谢组学研究,筛选两组间的差异性代谢产物,发现可以做为NAFLD另外一种特殊诊断手段的代谢物,探讨与疾病相关的可能的发病机制,为该病的治疗提供些许思路。⑵利用气相色谱质谱(gas chromatography mass spectrometry, GC-MS)衍生化法对生物样本中的非极性氨基酸进行定量检测;探讨疾病组与正常对照组中非极性氨基酸的差异及其意义。
  方法:①利用超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱(UPLC/Q-TOF-MS)的平台,应用代谢组学的方法,结合现代分析方法,研究NAFLD患者(n=24)和健康对照组(n=22)之间的内源性代谢物发生的变化。采用软件MarkerView v1.2.1对实验的原始数据进行提取和归一化处理,运用Metaboanalyst3.0软件做主成分分析(Principal component analysis, PCA)和正交偏最小二乘法判别分析(Orthogonal partial least-squares discriminant analysis, OPLS-DA)。根据SIMCA-P13.0软件分析中的标量投影重要性(Variable importance in projection, VIP)值,结合单变量统计分析中的 P值,对 NAFLD患者和健康对照人群差异性离子进行选择,并且进行鉴定。利用Metaboanalyst3.0软件对鉴定出的差异性代谢物质进行代谢通路的分析,采用受试者工作曲线(Receiver operating characteristic, ROC)对代谢物的临床诊断效能进行评价。②取100μL羊水上清液,加入甲醇去蛋白后提取上层清液吹干,进行MSTFA衍生化,利用GC-MS检测并分析检测结果。
  结果:⑴非肥胖的NAFLD患者和健康对照组代谢物的表达模式,在PCA和 OPLS-DA分析模型中均能很好的区分开来。在两组之间鉴定出了17种具有统计学差异的代谢物,这些物质包括类固醇激素及其衍生物,脂肪酸酯,羧酸及其衍生物,苯及其衍生物,尿酸等。与健康对照组相比,NAFLD患者代谢物水平升高的有:亮氨酸、正亮氨酸,鹅去氧胆酸,牛磺胆酸,左旋肉碱,花生四烯酸,脯氨酸,高龙胆酸,尿酸,肌酸酐,7,8-Dehydroastaxanthianthin,羟基丁酸,谷氨酸。比正常对照组下降的物质有棕榈油酸,棕榈酰胺,3-苯氧基苯甲酸,甜菜碱。同时,非肥胖的NAFLD患者的代谢通路亦发生了异常,这其中包括:丙氨酸-天冬氨酸-谷氨酸代谢通路,花生四烯酸酸代谢通路,精氨酸-脯氨酸代谢通路,谷氨酸盐代谢通路。⑵该方法具有良好的灵敏度、精密度、准确度以及回收率。在最优化的检测条件下,被检测氨基酸最低检出限为0.12~0.38 mg/L,线性范围为0.5~10 mg/L,添加回收率在91%~104%之间,日内及日间相对标准偏差(RSD)在0.84%~9.33%之间。用建立的方法对17例疾病组和13名正常组孕妇的羊水样本进行测定,统计分析结果表明,疾病组孕妇羊水中亮氨酸和异亮氨酸含量显著降低(P<0.01),其余3种氨基酸水平无明显差异。
  结论:①利用代谢组学的研究方法,本研究发现非肥胖的NALFD患者体内存在着多种内源性代谢物的改变。本研究获得的结果对于我们深入理解非肥胖NAFLD的发病机制有重要的意义。同时,对临床工作者在该病的诊断及治疗提供参考依据。②本方法经方法学验证,可作为羊水中氨基酸含量的测定方法,具有良好的应用前景;亮氨酸的减少可能参与了先天性畸形的发生。

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