大鼠、豚鼠与金黄地鼠尿液蛋白质组比较

摘要

目的: 寻找生物标志物就是寻找与机体生理或病理过程相关的可监测的变化。尿液，作为体液重要的组成部分之一，在生物标志物研究方面有巨大的优势。尿液不受稳态的调节，从而更好甚至更早的反应机体在疾病状态的变化。尿液易受到其他因素影响，例如饮食、性别、年龄、生活习惯、种族等，因此进行尿液蛋白疾病标志物研究，就必须排除这些因素影响。而临床采样无法避免这些因素影响，需要更大的样本量来平衡这些因素差异，但是仍然存在一些因素是无法平衡消除的。因此就需要遗传背景单一、生活环境等完全一致的动物模型来模拟疾病进展，从而寻找更准确、特异的疾病标志物。科研中，大鼠是常用的模型动物，但是它不能成为所有疾病的优势模型动物。因此建立大鼠与其他动物生理状态下的尿液蛋白大数据，就显得尤为重要，这为选择不同疾病的优势模型动物提供一定参考价值。 方法: 采集大鼠、豚鼠和金黄地鼠的尿液样本，通过膜上酶切切成肽段，再通过液相色谱和串联质谱偶联技术（LC-MS/MS）分析肽段信息，再通过生物信息学技术比较大鼠、豚鼠和金黄地鼠的尿液蛋白。 结果: 通过液相色谱和串联质谱偶联技术（LC-MS/MS）鉴定和软件分析后，再通过Uniprot分别与人的同源蛋白进行比对，结果显示豚鼠尿液含有人的同源蛋白340个，大鼠尿液含有人同源蛋白266个，金黄地鼠尿液含有人同源蛋白366个。本研究鉴定出三鼠都有的可信蛋白有88个，而大鼠独有的可信蛋白86个，豚鼠独有的可信蛋白141个，金黄地鼠独有的可信蛋白160个。 本研究通过软件对比分析发现，三种动物的尿液蛋白参与的生物过程、通路、分子功能等方面差异很大，在机体不同系统中，三种动物的尿液蛋白表达情况差异很大。 结论: 蛋白质组学方法比较大鼠、豚鼠和金黄地鼠尿液蛋白发现，三种动物尿液蛋白的表达情况和表达量都不同，因此，仅仅用大鼠来建立疾病动物模型无法研究所有疾病的尿液蛋白质组学，而且用大鼠模拟所有人类疾病的发生发展情况是片面的。 在各个系统各个器官中，大鼠、豚鼠和金黄地鼠尿蛋白表达情况都不同，并且它们参与的生物过程也都不同，其中大鼠的表达量最少，这表明在建立人类疾病模型选择模型动物的时候，金黄地鼠和豚鼠相对来说更占优势。而且具体到某个系统某个器官，三种动物的尿蛋白表达情况也不同，尿蛋白表达量高，所参与的生物过程多的动物，可能就是该器官或该系统的优势模型动物。

目录

声明

英汉缩略语名词对照

前言

参考文献

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

2 结果

2.1 尿蛋白的SDS-PAGE分析

2.2 尿蛋白的质谱鉴定结果比较

2.3 Gene ontology分析

2.4 Peptide Atlas分析

3 讨论

参考文献

附表1：三种动物的尿液蛋白转化成人同源蛋白后对比

文献综述:尿液蛋白质组的疾病研究进展

致谢

攻读硕士学位期间发表的论文