CDKN1C/p57kip2与乳腺癌发生及临床预后的相关性研究

摘要

目的: 研究发现CDKN1C基因表达与某些恶性肿瘤的发生、发展及预后具有密切的关系。然而，CDKN1C基因在乳腺癌中还没有相关文献报道。本课题将通过检测CDKN1C在乳腺癌中的表达情况并分析CDKN1C与乳腺癌病理特征以及预后的相关性，进而阐明CDKN1C在乳腺癌发生发展中的作用。 方法： 1.收集2014-2016年重庆医科大学附属第一医院乳腺癌手术病人的乳腺癌及癌旁组织，用于RT-qPCR和 Western blot实验检测CDKN1C在乳腺癌中的表达情况。 2．利用TCGA数据库，筛选出708例具有完整的临床信息的患者用于比较mRNA的表达水平以及与临床病例特征和乳腺癌预后的相关性。 3.利用基因富集分析软件GSEA software3.0和基因芯片GSE1456分析CDKN1C在乳腺癌中的潜在生物学功能及其相关信号通路。 结果： 在mRNA和蛋白水平，CDKN1C在乳腺癌组织中的表达相比正常乳腺组织的表达是明显降低的。 在Oncomine数据库里面，CDKN1C mRNA在不同乳腺癌亚型中的表达也是显著下调的。 CDKN1C的表达和年龄（p＜0.001）、肿瘤大小（p=0.012）有密切关系。 在ER、PR、HER-2阴性的乳腺癌患者中低表达的CDKN1C与不良预后有联系。Kaplan-meier生存曲线指出，低表达的CDKN1C和不良预后显著相关。 多因素分析指出CDKN1C可作为（HR=1.78/p=0.020）乳腺癌的独立预后指标。 基因富集分析指出CDKN1C低表达与mTORC1 signaling pathway和PI3K/Akt/mTOR signaling pathway通路有富集。与DNA修复、细胞周期、和糖酵解有富集。CDKN1C高表达与脂肪形成有富集。 结论: 通过前期的研究结果提示，CDKN1C可能在乳腺癌中发挥抑癌基因作用，而且很可能成为独立判断乳腺癌不良预后的重要指标。多元化分析也明确指出，CDKN1C与DNA修复、糖酵解、脂肪生成并且和PI3K/Akt/mTOR、Mtorc1两条通路有密切联系。

目录

声明

英汉缩略语名词对照

前言

1 材料与方法

1.1临床资料及实验试剂

2方法

2.1组织RNA的提取

2.2 RNA逆转成cDNA

2.3 RT-qPCR

2.4 Western blot

2.5 免疫组化

2.6 CDKN1C在TCGA数据库基因数据整理。

2.7 CDKN1C基因富集分析

2.8生物信息学分析

3统计分析

4结果

4.3 Western blot结果显示，CDKN1C在乳腺癌中表达水平低于乳腺癌旁组织

4.4利用4个乳腺癌组织芯片数据结合TCGA数据分析CDKN1C在乳腺癌中的表达模式

4.5 CDKN1C临床病理分析

4.6 CDKN1C的生存分析

4.7 CDKN1C的单因素及多因素分析

4.8 CDKN1C的预后分析

4.9 GSEA分析CDKN1C相关生物学功能和信号通路

5讨论

全文总结

参考文献

文献综述:CDKN1C在肿瘤中的研究进展

致谢

攻读学位期间发表论文情况