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KAP8、KAP6.3和FGF5基因变异对绒毛性状的影响及绒毛品质变化规律的研究

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论文说明:缩写词表

声明

第一章绪论

1研究目的和意义

2国内外研究现状

3主要研究内容

第二章试验研究

试验一内蒙古绒山羊绒毛品质变化规律研究

1前言

2材料与方法

3结果与分析

4讨论

5小结

试验二KAP8.1和KAP8.2基因变异与绒毛性状的关系

1前言

2材料与方法

3结果与分析

4讨论

5小结

试验三KAP6.3基因变异与绒毛性状的关系

1前言

2材料与方法

3结果与分析

4讨论

5小结

试验四FGF5基因变异与绒毛性状的关系

1前言

2材料与方法

3结果与分析

4讨论

5小结

第三章结论与建议

1主要研究结论

2创新点

3有待于进一步研究的问题

参考文献

致谢

附录

个人简介

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摘要

本研究采用候选基因的策略,通过分析绒毛形成的生理机制,选择与绒毛性状密切关联的角蛋白关联蛋白KAP8.1、KAP8.2、KAP6.3和成纤维细胞生长因子5(FGF5)基因,采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法检测基因变异,并分析基因变异与绒毛性状的相关性。本研究从四个方面进行研究: (1)系统探讨年龄和年份与绒山羊产绒性能和绒毛品质间的变化规律,结果表明:不同年龄间产绒量、绒长度、毛长、体重、绒纤维细度和伸直长度均有显著差异(P<0.01),内蒙古白绒山羊2~4岁生产性能和绒毛品质处于最佳阶段,5~6岁时产绒性能下降,6岁后生产性能大幅下降,绒毛品质明显降低;年份对绒山羊产绒量、绒长度、毛长度和体重有显著影响(P<0.05),各年份产绒性状表型值波动较大,说明年际效应显著,2000年后性状表型值得到稳定提高。 (2)以KAP8.1和KAP8.2为候选基因,检测其基因多态性与内蒙古绒山羊绒毛性状的连锁关系,结果表明:KAP8.1基闵编码区发现T113G和G116C两个SNP位点(GenBank accession no. AY510122),这两个突变未改变氨基酸序列;关联分析结果表明不同基因型对产绒量有显著影响(P<0.05),但对其它各性状没有影响(P>0.05);AB基因型利BB基因型产绒量显著高于其它基因型,分析认为该效应可能是由于T113G突变造成,表明KAP8.1基因多态性可能是绒山羊产绒量的一个分子标记;KAP8.2基因编码区发现A214G和T218C两个SNP位点(GenBank accession no.AY510123),A214G突变是同义突变而T218C是错义突变;关联分析结果表明,基因型对绒纤维细度、产绒量和毛长度有显著影响(P<0.01),但对绒长度无显著影响(P>0.05);AA 基因型(0.73)是群体的优势基因型,该基因型个体绒纤维细度显著低丁其它各基因型,表明KAP8.2基因多态性可能是绒山羊绒纤维细度的一个分子标记。 (3)以KAP6.3基因为候选基因,采用PCR-SSCP技术对其编码区和3'-非翻译区进行多态性扫描,并分析其变异与绒毛性状的连锁关系。结果表明:山羊KAP6.3基因(GenBank accession no.AY310751)共发现10个SNPs位点,分别是C89T、T110C、C134T、C149T、G163A、G170A、A217G、A229C、G389A和A437G。其中G163A、A217G和A229C突变是错义突变,G389A和A437G突变位于3'-UTR,其余5个SNPs位于编码区,是同义突变。对K2引物,群体以A等位基因为主,AB基因型是优势基因型,其产绒量显著高于其它各基因型(P<0.05)。K3引物检测剑九种基因型,F平H基因型的产绒量最高,且绒长度最长;而G和I基因型的产绒量最低,且绒长度最短;F和H基因型与G和I基因型的这两个性状最小二乘均数相比均达剑显著水平(P<0.01)。K4引物的AC基因型绒纤维细度最小,显著低于其它基因型(P<0.05),BB基因型的绒长度利毛长度显著高于其它基因型(P<0.05)。 (4)以成纤维细胞生长因子5(FGF5)基因为候选基因,检测其基因多态性,寻找与绒山羊被毛长度相关的遗传标记,结果表明:FGF5基因外显子1存在限制性内切酶Bgi Ⅰ多态位点,测序结果发现该SNP是由碱基序列C→T的突变而引起;基因型利基因频率统计结果表明,该试验群体以等位基因A具有明显的优势;基因多态与绒毛性状关联分析表明,该SNP对各绒毛长度的影响不显著(P>0.05),但AB基因型毛长度大于AA基因型。

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