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【24h】

単一拡散因子による反応拡散系の時空間パターン形成

机译:单次扩散因子的两种时空模式形成反应扩散系统

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摘要

生体内では数多くの化学物質が互いに反応し,また空間的に拡散する.このような化学物質の反応と拡散のダイナミクスは,反応拡散系としてモデル化されることが広く知られている.この系では,Turing パターンと呼ばれる空間的なパターンが自律的に生じることが知られており,理論的,実験的に研究がされてきた.代表的な反応拡散系のモデルとして,Gierer-Meinhardt モデルやGray-Scott モデルが挙げられる.これらの系は,反応は2 種類の化学種からなり,いずれの化学種も空間中を拡散するものとしてモデル化されていた.このような系のダイナミクスは,これまでに多くの研究が行われており,activator-inhibitor と呼ばれる反応構造の存在が,パターン形成に重要な役割を果たすことが知られている.一方で,近年,構成生物学の分野においては,生物細胞のクオラムセンシング機構を用いた細胞の空間パターン形成が注目を集めている.文献では,バクテリア細胞同士が,細胞膜を通過できるシグナリング分子を介して,「交信」することにより,細胞間の濃度差が生じ,空間的なパターンが生じるメカニズムが提案された.この現象は,細胞が空間に連続的に存在するもの仮定することで,反応拡散系を用いてモデル化できる.しかし,多くの従来研究と異なり,拡散可能な物質は,細胞間のシグナリング分子1 種類のみであり,そのような系に対するTuring パターンの形成条件やその種類についていの一般的な解析は,十分に行われているとは言えない.以上の背景を踏まえ,本稿では単一拡散因子による反応拡散系を解析対象とし,この系において生じうる時空間パターンの分類とそのパターン形成条件を明らかにすることを目的とする.本稿の構成は以下のとおりである.まず2 節で,単一拡散因子による反応拡散系の数理モデルを提示し,単一拡散因子による反応拡散系が,無限個の定数フィードバックゲインをもつSISO システムに分解されることを述べる.つぎに3 節で,この系におけるTuring パターンを根軌跡によって分類する.その後,4 節でパターン形成条件を,5 節でその構成法と具体的な構成例を示す.6 節では,非線形の反応拡散モデルを用いて,理論的結果の妥当性を確認する.最後に7 節でまとめを述べる.
机译:多种化学品与体内彼此反应,也扩散空间。与这些化学品的扩散的动力学反应可以被建模被广泛地称为反应 - 扩散体系。在该系统中,所述空间图案称为图灵图案已知自主生成的,从理论上说,已经实验研究。代表性的反应 - 扩散系统模型包括Gierer-迈进模型和灰色斯科特模型。这些系统中,反应包括两个物种,该物种的一个也被建模为在该空间扩散。这样的系统的动态特性是迄今所进行的许多研究,反应结构的存在称为活化剂 - 抑制剂已知在图案形成中起重要作用。在另一方面,近年来,在建筑生物学领域,与生物细胞的群体感应机制细胞的空间构图而备受瞩目。在文献中,细菌细胞彼此,通过可穿过细胞膜,通过“通信”的信号分子,细胞之间的密度差发生时,已被用于空间图案时提出的机制。这种现象,即假设旨在连续地存在于该空间中的细胞可以使用的反应 - 扩散体系进行建模。然而,与许多以前的研究中,扩散物质仅信令单元的分子的一种类型的细胞,一般分析形成条件或具有用于该类型用于这种系统图灵图案的,充分,不能说是已经完成。基于上述背景,在本文中我们分析了反应 - 扩散体系具有单一的扩频因子,并且其目的是澄清分类和图案形成的条件,可以发生在该系统中的时空图案。本文的配置如下。在第2节礼物用单个扩展因子的一个单一的扩频因子,反应 - 扩散体系的反应扩散系统的数学模型进行说明与恒定反馈增益的无限数量被分解为SISO系统。然后,在第3节,在这个系统中的图灵图案通过根轨迹分类。此后,图案在第4节形成条件,具体的结构例和第5节及其构建方法。部6,使用反应扩散模型非线性,为了确认的理论结果的有效性。最后,我们总结在第7节。

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