FMO計算に基づくマルチスケールシミユレーションのナノバイオ系への応用

摘要

近年、ドラッグデリバリーシステム(DDS)や生体膜を模したセンサーなど、分子をナノレべ ルで制御した機能性材料の研究開発が盛んに行われている。そうした材料の構造予測には散逸粒 子動力学(DPD)[1]といった粗視化シミュレーシヨンが有効だが、粒子間の相互作用を示すパラメ ータの算出に大きな課題があった。そこで我々はここ数年、DPDで使われる有効相互作用パラメ ータをフラグメント分子軌道(FMO)計算[2]に基づいて算定するFMO-DPD連携マルチスケール シミュレーションを進めており、応用計算も含め本学会で何度か報告を行っている。今回は、パ ラメータ算定の自動化ツール(FCEWS)[3]を開発したことを中心に、DDSへの端緒として行ってい るリボソーム形成のDPDシミュレーシヨンの他、研究グループ内で新規開発されたDPDコード (CAMUS)[4]によるタンパク質の二次構造の形成について報告する。