Nicked DNAが引き起こすナノポアとの相互作用

摘要

ナノポアは分子がポアを通過する際のイオン電流の変化により、sub分子レベルの感度があり、究極のゴールはシークエンシングである。しかし、lambda DNA（16.5 µm）のような長いDNAはナノポア通過時に詰まる。その要因は未解明で、DNAの幾何学的影響か、溶媒イオンによる電気浸透流の影響かが問われる。そこで、我々はDNAの長さと詰まりの頻度とnick(二本鎖の一方を酵素で切る)による詰まりの頻度の変化を調べた。興味深いことに、flexibleになったはずのnickありのDNAのほうが詰まる傾向が現れた。