六个转录组分析厚壁毛竹的笋芽生长发育

摘要

厚壁毛竹(Phyllostachys edulis'Pachyloen')是毛竹多个变异类型中唯一一个有用材价值的优良新品种,但其分子遗传机制并不为人所知.利用第二代高通量测序技术从霜降节气开始,对从霜降、大寒、冬至、雨水、春分、谷雨6个节气采集的厚壁毛竹笋芽分别进行转录组测序,共捕获30555个基因,基因平均覆盖率79％.将不同节气的竹笋的转录组进行两两比较,首次证实厚壁毛竹笋在不同节气基因表达有差异,其差异表达基因数从2288个到12991个不等,进一步将这些差异表达基因进行了GO功能注释和KEGG Pathway富集性分析,并初步报道了DNA复制、类胡萝卜素生物合成、淀粉和蔗糖代谢3个代谢通路的基因表达模式,在一定程度上解析了厚壁毛竹“竹壁特厚”等种质性状的分子调控模式及其机制.