中华绒螯蟹内源性白斑综合症病毒基因EjsWSSV的克隆与鉴定

摘要

基于已获得的表达序列标签序列,应用RACE技术从中华绒鳌蟹基因组中获得了一个白斑综合症病毒基因(EjsWSSV)的全长cDNA序列,全长为3864bp并包含一个3732bp的开放阅读框,编码一个138.25kDa的含1243个氨基酸的多肽,编码的氨基酸序列包含一个VWA结构域。通过序列比对、序列结构比较和一些生物信息学预测分析,表明EjsWSSV蛋白序列与白斑综合症病毒基因组的ORF16具有高同源性,它不含有信号肤和跨膜区,为非分泌型和α-螺旋型蛋白,可能定位于细胞质。通过pcR检测验证,EjsWSSV基因可能为内源性病毒基因.