禽传染性支气管炎病毒分离株S1基因系统进化分析

摘要

对11株2010年分离的IBV分离株的S1基因进行了PCR扩增,建立基于879株IBV的全长S1基因系统进化树,对11个分离株进行系统进化分析。结果表明：11株分离株均获得了预期大小的目的条带，11株分离株的S1基因长度介于1614～1620bp之间，A+T的含量介于63.21～63.83％-之间。11个毒株S1基因之间的遗传距离为0.001～0.328，同源性为78.3～99.9％。建立基于879条IBV S1基因的系统进化树，发现来自全球的879株IBV的S1基因可以分为5个群，其中中国IBV分离株在clusterⅡ/Ⅳ/Ⅴ中有分布，说明中国是全球IBV的S1基因型最丰富的地区。本研究中的11株IBV毒株分布在ClusterⅤ的3个亚群中,均与其他中国分离株的亲缘性较近,且多属于疫苗株以外的基因型，提示中国应考虑使用新的与本地株亲缘关系较近的IBV毒株研发疫苗。本研究丰富了IBV分子流行病学素材,为IBV分子流性病学研究中对新分离株的基因型判定提供科学依据。