38株维氏气单胞菌分离株的AFLP基因分型研究

摘要

本试验通过人工设计合成的通用接头以及与接头序列相匹配的专用引物,对38株维氏气单胞菌分离株和1株维氏气单胞菌标准菌株进行AFLP基因分型研究。结果显示,采用5对引物使39株维氏气单胞菌扩增出1080可见条带,片段长度在50～1000 bp之间,其中多态性条带727条,平均每对引物组合产生154条多态性条带,平均多态性检出率为66.7％。按UPGMA方法对条带进行聚类分析,建立聚类分支树状图,将39株维氏气单胞菌分为9个基因型,其中第四类群基因Ⅳ型包含了14株菌株,约占总菌数的35.9％,分布在5个不同的地区,推测其可能是引起斑点叉尾鮰发病的主要流行性基因型。不同地区分离的维氏气单胞菌具有地域性差异,但同一地区分离株也存在相同基因型以及基因型多样性现象。