利用近缘属转录组信息开发桃EST-SSR标记

摘要

随着分子标记技术的发展,SSR标记技术被广泛地应用于物种遗传多样性及种质鉴定研究中.本研究以同是蔷薇科的枇杷转录组信息得到的192对EST-SSR标记为引物,两个普通桃晚湖景和锦绣,及蟠桃红蟠桃为供试材料进行PCR扩增,拟发掘适宜桃物种的EST-SSR标记.结果如下,在枇杷中都具有扩增的192对引物,在桃子中有16对未有扩增产物,扩增效率为91.56％;16对扩增杂合双条带型,31对是非特异多条带型,剩余129对是纯合单条带型.在47对杂合带和非特异带型中,其中有34对在枇杷扩增中为单带型,10对是双带型,3对是非特异扩增.在两个物种中都是杂合带或非特异扩增的只占5.73％;而且不同的品种扩增略有不同,有两对EST-SSR引物可以区分供试的3份材料,有8对引物在三个供试样本中同时扩增出杂合带或多条带.上述结果表明,枇杷转录组开发的EST-SSR标记可以用在桃物种中,为发掘桃物种EST-SSR标记提供理论依据.