云南盐矿和新疆盐湖拟诺卡菌株生物地理分布及遗传进化初探

摘要

本研究通过新疆盐湖和云南拟诺卡氏属菌株遗传进化差异来阐述拟诺卡属菌株地理分布的特征。利用DNA-DNA序列相似性和16S rRNA基因序列相似性相关性来进一步确定拟诺卡氏属菌株之间的亲缘关系，并通过gyrB、rpoB、sodA三个看家基因的串联分析研究拟诺卡氏属菌株7个类群在不同盐环境的地理区域分布特征。结果，发现只有3个OTUs在gyrB基因分析中有较弱的地域分布特征，3个OTUs在rpoB基因中有较为明显的地域分布特征，4个OTUs在sod A基因中有较为明显的地域分布特征。而在三个基因串联分析中7OTUs都有较为明显的地域分布特征。因此推测三个基因受到的环境选择压有差异，所以拟诺卡氏属菌株在三个基因的遗传进化上形成的地理分布也有很大差异。