基于iTRAQ技术的不同发育时期石榴籽粒的定量蛋白质组学研究

摘要

目的：探究石榴籽粒软硬形成的分子机制. 方法：以'突尼斯'软子石榴和'三白'硬子石榴籽粒为试材,利用iTRAQ技术分析软子石榴与硬子石榴在籽粒硬度形成过程中蛋白表达丰度的差异. 结果：通过质谱鉴定,共得到1940个蛋白,其中被定量的蛋白有1889个,根据蛋白的表达丰度,将相对表达量大于或小于1.5倍且T检验值小于0.05的蛋白点定为差异表达蛋白,通过分析,共得到154个差异表达的蛋白,其中上调表达的蛋白有75个,下调表达的蛋白有60个,共同表达蛋白的有19个.对这些差异表达的蛋白进行了功能注释如GO注释、亚细胞定位、KEGG代谢通路注释、功能富集聚类分析如GO富集、结构域富集,代谢通路富集等生物信息学分析. 结论：发现在籽粒发展过程中,数个蛋白基因涉及到次生细胞壁生物合成与降解中,如F5H、XYL、Elongation factor l-beta、Elongation factor l-delta及Profilin等,为阐明石榴籽粒软硬形成的分子机制奠定理论基础.