PCR-DGGE法分析不同产地蝉花真菌多样性

摘要

目的：本研究采用PCR-DGGE的方法对安徽、江苏、四川、广西等十个产地的蝉花的真菌多样性进行了分析,以期获得蝉花优势寄生真菌. 方法：通过提取样品总DNA,采用真菌通用引物NS1、Fung扩增18S rDNA,将PCR产物DGGE电泳后,染色后对16个差异性条带进行了切胶回收、克隆测序以及BLAST数据库比对验证;对不同产地蝉花的电泳图谱进行了相似度以及多样性指数分析. 结果：广西玉林产地蝉花的条带数最多为16,H=2.679;四川北川、四川绵阳、广东河源三个产地的蝉花真菌多样性相似较高. 结论：克隆测序结果表明共有条带3和9代表的真菌为不同产地的蝉花的优势寄生真菌蛹虫草(Cordyceps militaris);除了三种未获得纯培养的节担菌纲(Uncultured Wallemia)和真核细胞外(Uncultured eukaryote)外,其余的为Eurotium athecium、Magicicada cassini、Myrothecium roridum、Aspergillus penicillioides等菌.