Toll样和RIG-Ⅰ样受体基因序列变异与云南家牛地方品种间抗病力差异的关联分析

摘要

本研究选取了5个云南家牛地方品种共144个样本,包括昭通牛32个、滇中牛20个、文山牛30个、云南高峰牛32个及邓川牛30个,其中云南高峰牛为瘤牛(Zebu cattle)类型,其余4个品种为普通牛(Taurine cattle)类型.此外,还从GenBank数据库中下载了其它牛亚科(Bovinae)部分物种的同源序列,选用水牛(Bubalus bubalis)序列作为外群,并结合欧洲野牛(Bison bonasus)和牦牛(Bos grunniens)序列进行了系统发育分析.首先采用PCR产物直接测序法测定了上述5个地方品种样本的Toll样受体基因TLR3和TLR8、RIG-Ⅰ样受体基因DDX58三个基因的DNA序列;其次采用了群体遗传分析方法进行了遗传多样性分析、构建了中介网络图、检测了选择作用信号、开展了变异位点的功能预测分析;最后探讨了重要序列变异位点与云南家牛地方品种间抗病力差异之间的联系.