从广西繁殖障碍猪分离的猪瘟病毒E2基因的多态性分析

摘要

本研究采用RT-PCR技术对来自广西不同地区的猪流产胎儿与死胎82份、新生仔猪33份和老母猪白细胞172份进行猪瘟病毒检测,结果共有9份为阳性,从阳性病料中选取6份进行猪瘟病毒E2基因的克隆、测序,得到长度为1119核苷酸的目的基因片段.应用DNAstar序列分析软件对所测定的6个毒株与已知序列的HCLV、Shimen等毒株的相应片段进行同源性分析比较.结果显示,GXGZ02株与HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分别为82.3％和84.2％,其余5株与HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分别为96.8％～97.3％和94.3％～94.9％,推定的氨基酸同源性分别为89.8％～96.4％和91.2％～94.5％.根据遗传进化树分析,广西毒株分为2大群,GXGZ02株属于基因Ⅱ群,其余5株与HCLV、Shimen同属于基因Ⅰ群.