IBDV-VP2基因高变区同义密码子在蛋鸡和乌鸡中的偏嗜性

摘要

以RT-PCR方法对洛阳地区2000年到2002年间分别从IBD发病蛋鸡及乌鸡鸡群中分离到的5株和4株IBDV进行了VP2高变区基因的扩增、克隆和测序.核苷酸和氨基酸序列分析发现,9株IBDV中有4处氨基酸发生了变化,即320位的Gln/His,349位的Val/lle,375位的Pro/Ser和381位的Lys/Arg.这些氨基酸的变化,不符合变异株的特征.核苷酸序列变化主要表现在同义密码子的置换.分别将分离于蛋鸡和乌鸡的各3个毒株交叉感染乌鸡和蛋鸡鸡胚,盲传7代后取尿囊腔绒毛膜分离病毒进行VP2基因的序列分析.结果表明,IBDVVP2基因高变区某些氨基酸同义密码子在蛋鸡和乌鸡细胞中的选择上有偏嗜性.主要表现在第一亲水区220位的Tyr(TAC/TAT);224,360,393位的Gly(GGA/GGG);260及420位的Thr(ACC/ACT,ACA/ACT);271位Val(GTA/GTG);279位Asp(GAC/GAT);305位lle(ATC/ATA)及328位的Ser(TCA/rCG).病毒在不同品种宿主中对同义密码子使用的偏嗜性,既可能是导致蛋鸡和乌鸡对IBDV易感性不同的一个重要原因,也可能是病毒变异及新毒株产生的一条重要途径.