猪嵴病毒的分子特征及流行病学研究

摘要

猪嵴病毒属于小核糖核酸病毒科Kobu病毒属成员,为单股正链RNA病毒,该病毒于2007年在匈牙利首次发现。此后,在一些亚洲和欧洲的国家不断有本病感染的报道。本文首先对Kobu病毒的由来、分类、基因组结构特征、猪嵴病毒的发现、流行病学及其病原学检测等方面进行了阐述;然后利用生物信息学软件比较分析了GenBank中已公布的9株猪嵴病毒全基因组和各基因的核苷酸及推导的氨基酸的同源性,结果表明,无论是在全基因组、各基因还是氨基酸水平,分离株swine/K-30-HUN/2008/HUN和swine/S-1-HUN/2007/Hungary之间的同源性均最高。在病毒基因结构的5'-UTR区域,分离株CH/HZ/2011和XX分别存在一个连续18个核苷酸和64个核苷酸缺失;在2B蛋白编码区域,CH/HNXX-4/2012和CH/HZ/2011分离株均存在一致的连续83个核苷酸缺失。在氨基酸水平,9株PKV分离株3D蛋白的同源性为最高,而VP1蛋白的同源性最低。系统发育分析显示,9株病毒的3D和VP1基因进化方向一致。