不同钾水平下花魔芋差异表达基因分析

摘要

为了探索魔芋对不同水平钾素营养的反应机制,提取施用低、中、高水平硫酸钾后5d的富源花魔芋叶片总RNA,合成了cDNA,采用优化的cDNA-SRAP技术体系分析了在低钾、中钾、高钾水平下富源花魔芋叶片的差异表达基因,并对其进行了生物信息学分析.结果显示:29对引物组合共扩增出507条基因片段,其中差异片段126条.相对于中钾处理,低钾、高钾处理的差异片段包括抑制型表达片段19条,诱导型表达片段14条,上调表达型片段29条,下调表达型片段64条.选取表达量高的13条差异片段进行回收测序,在NCBI上进行BLAST比对,共比对出9条差异片段的同源序列,其中4条与已知功能基因(谷氨酰胺酰-tRNA合成酶、β-ATP合成酶、GTP结合蛋白、核苷酸还原酶)有较高同源性,5条与假定基因或预测基因同源性较高,剩余序列未找到同源序列,可能是一些新的魔芋与钾营养吸收利用相关的基因,具体功能还有待于进一步研究.