SPF鸡不同生长阶段粪便菌群组成及多样性研究

摘要

目的：提供SPF鸡不同生长阶段肠道菌群的组成及多样性数据. 方法：采集10日龄、12周龄、23周龄和52周龄SPF鸡粪便,利用Illumina HiSeq2500高通量测序方法,对样品16S rRNA的两个高变区(V3-V4)进行测序分析,并进行了α多样性指数、β多样性指数和粪便群落特征分析. 结果：四个生长阶段粪便样品菌群具有相似的较高的丰富度和良好的均匀度,物种多样性无显著差异(P＞0.05);厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度占95％以上;乳杆菌属(Lactobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、拟杆菌属(Bacteroides)、肠球菌属(Enterococcus)为优势菌属,不同时期丰度差异达显著水平(P<0.05). 结论：四个生长阶段菌群组成多样,且优势菌群主要为有益菌.该实验结果能够为SPF鸡品质评定、健康监测和安全性评价提供依据.