2015年中国七个地区猪流行性腹泻病毒ORF3和S1基因的遗传进化分析

摘要

旨在了解2015年中国七个地区引起仔猪腹泻的猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行现状及遗传进化情况,试验采用RT-PCR方法对采集的165份腹泻病料进行检测,针对PEDV ORF3和S1基因进行扩增及测序,并对其进行遗传进化分析.结果表明:PEDV的阳性率为83.03％,ORF3基因和S1基因的核苷酸同源性分别为98.2％～100％和96.6％～100％,其中HLJ2015/DP1-1毒株与经典毒株CV777相比,S1基因在1130～1141bp之间有12个核苷酸缺失;S1基因系统进化树分析显示,PEDV S1基因分为GⅠ群和GⅡ群,此次试验鉴定的PEDV毒株属于GⅡ群的non S-INDEL型毒株.