小反刍兽疫病毒全基因组遗传进化分析

摘要

为了确定我国小反刍兽疫各毒株间的进化关系,本研究从GenBank下载世界各国PPRV全基因组序列,以生物信息学方法建立遗传进化树.搜集到30株PPRV全基因组序列,其中我国10株,印度3株,巴基斯坦0株.2013-2014年毒株在同一个分支,2014年北京毒株和同年份的其它毒株相比枝条最长,2015年新疆巴州毒株独立成一个小分支.2014-2015年每一个毒株和2013年新疆伊犁毒株相比,遗传距离都最近,最小值为0.0011.2007-2008年毒株位于另一分支,2007年西藏两毒株间遗传距离为0.0006.毒株间的遗传关系跟地理位置呈正相关.本研究揭示国内疫情传播路线可以为我国小反刍兽疫的防控提供线索和技术支持.