雷公藤CYP88A1基因全长cDNA的获得及生物信息学分析

摘要

研究根据雷公藤悬浮细胞转录组数据设计引物,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从雷公藤悬浮细胞中克隆得到一条CYP45088A1全长cDNA,并对其进行多重序列比对、蛋白结构预测及构建系统进化树等生物信息学分析,同时,利用实时荧光定量法分析基因表达情况.所获得的序列cDNA全长1594bp,包含了一个长1476bp的完整开放阅读框,编码491个氨基酸,等电点为9.16,相对分子质量为55.937kDa.具有半胱氨酸铁血红素配体信号活性催化位点,亚细胞定位预测显示其可能位于叶绿体膜上.实时荧光定量检测结果显示,该基因在茉莉酸甲酯处理后相对表达量显著下降,本实验首次克隆了雷公藤CYP88A1基因,为进一步研究雷公藤萜类生物合成途径奠定基础.