用于检测石斑鱼虹彩病毒(SGIV)感染的DNA核酸适配体筛选

摘要

目的：石斑鱼虹彩病毒(Singapore grouper iridovirus,SGIV)是大分子DNA病毒,近年来对石斑鱼养殖产业造成严重经济损失.因此急需发展可以快速检测和抑制SGIV感染的技术手段. 方法：利用指数富集的配基进化技术(SELEX),针对SGIV感染的石斑鱼细胞进行筛选特异性的核酸适配体(Aptamer). 结果：获得四条特异性的Aptamer.二级结构的预测结果发现,核酸适配体均形成典型的颈-环结构.细胞毒性试验和组织水平的观察结果显示,筛选得到的核酸适配体无任何毒副作用.筛选得到的核酸适配体不仅可以特异性地识别并结合SGIV感染的细胞,而且可以在组织水平上检测到SGIV的感染.其中,核酸适配体L1与SGIV感染的细胞的结合亲和常数最高,为71nM.筛选得到的核酸适配体可以抑制病毒的感染,其中适配体L1的抑制效果最明显,并且以梯度依赖的形式抑制病毒的感染. 结论：研究首次运用SELEX技术筛选与海洋鱼类大分子DNA病毒SGIV感染的细胞特异性结合的核酸适配体,这些核酸适配体作为抗病毒候选药物或用于病毒检测,具有极为广阔的应用前景.