聚苹果酸生产菌出芽短梗霉CCTCC M2012223的全基因组测序及序列分析

摘要

目的：解析出芽短梗霉CCTCC M2012223的基因组序列信息,分析其代谢产物聚苹果酸、黑色素、普鲁兰多糖合成相关基因,为深入研究遗传多样性和代谢工程改造提供序列背景信息.rn 方法：使用Illumina HiSeq高通量测序平台对CCTCC M2012223菌株进行全基因组测序,使用相关软件对测序数据进行序列拼接,基因预测与功能注释,COG/GO聚类分析,共线性分析等.下载其他5株出芽短梗霉基因组序列,比较分析6株菌的种内同源基因、全基因组进化以及代谢产物合成相关基因.rn 结果：出芽短梗霉CCTCC M2012223基因组序列全长30756831bp,GC含量47.49％,编码9452个基因.比较基因组分析表明出芽短梗霉CCTCC M2012223的基因组组装长度最长,6株菌的同源基因数达到7092个,普鲁兰多糖和聚苹果酸合成相关基因的蛋白序列有很高的保守性.A.pullulans CCTCC M2012223和A.pullulans var.melanogenum具有较好的基因组共线性关系,而这两株的黑色素合成相关基因的蛋白序列有一些插入和突变.rn 结论：本研究解析了出芽短梗霉CCTCCM2012223的基因组序列信息,得到黑色素、普鲁兰多糖和聚苹果酸合成相关基因,为后续的代谢机制解析和改造奠定了理论基础.