建兰基因内部SSR标记的初步开发

摘要

建兰是兰属植物中的一种,香气袭人,具有很高的观赏价值.目前,其分子标记数量有限.为了开发可靠、有效的分子标记,本研究对建兰转录组数据进行SSR搜索,根据基元、长度和所在位置选取30个SSR进行引物设计.在10个建兰品种中尝试性地扩增,结果发现22个引物成功扩增,其中12个引物有多态性,其PIC范围为0.160～0.770,平均为0.371.然后对能成功扩增的30个SSR所在基因序列进行基因注释,发现29个比对上了数据库的序列.这12个多态性标记可用于建兰的遗传多样性、图谱构建和基因定位等研究,相应的基因注释信息丰富了这些标记的内涵.