棉花EST-SSRs标记的开发及其在基因组与分子育种研究中的应用

摘要

EST-SSR是基于基因组转录区域的SSR序列.随着不同棉种不同发育时期的转录组大规模测序,为EST-SSR标记的开发提供了大量资源.作为表达基因的一部分,EST-SSR必然与基因功能有一定联系,使基于EST-SSR标记的基因组研究和分子标记辅助选择育种目标更明确.利用网上公布的亚洲棉Gossypiumarboreum(Agenome)、雷蒙德氏棉G.raimondiiUlbr.(Dgenome)及本室的陆地棉G.hirsutum(ADgenome)等不同棉种纤维混合cDNA文库的单边随机测序的EST序列信息,进行了EST-SSR在不同棉种转录区域的分布频率、海陆棉种中的多态水平、在四倍体棉种的不同亚组间分布及在基因组研究中的应用潜力等方面进行了研究.