利用宏基因组学技术分析煤层水中微生物在不同培养条件下的多样性

摘要

原始煤层水样取自寺河某煤层气并排采口,采用厌氧操作技术,按50 U罐分别加入两个200 L氮气置换的发酵罐中,加入50L培养基,其中一个发酵罐另加入寺河煤样10kg,控制培养温度25℃,培养1个月和2个月后分别收集两个发酵罐中发酵液,采用Omega水样DNA提取试剂盒提取原始水样、培养1个月和2个月发酵液等共5个样品总DNA,扩增样品16S rDNA V6区片段后进行Illumina测序.结果显示,原始水样中丰度大于5％的物种为丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、嗜甲基菌科(Methylophilaceae)、链球菌科(Streptococcaceae)和肠杆菌科(Enterbacteraceae),嗜氢菌科(Hydrogenophilaceae)、红环菌科(Rhodocyclaceae)、假单胞菌科(Pseudomonadaceae)、莫拉氏菌科(Moraxellaceae)、脱硫微菌科(Desulfomicrobiaceae)、红细菌科(Rhodobacteraceae)和螺旋体科(Spirochaetaceae)也是其中的优势菌群.