H5N1亚型高致病性禽流感病毒NS基因的克隆及序列分析

摘要

采用RT-PCR技术特异地扩增了4株H5N1亚型高致病性禽流感病毒的NS基因,将获得的PCR产物分别与T载体进行连接,获得了4个毒株NS基因阳性克隆.阳性克隆序列分析结果显示分离毒株间核苷酸同源率在90.2~98.7﹪之间,氨基酸同源率在82.6~97.8﹪之间.与其它毒株比较A/Chicken/Heilongjiang/P46/2003和A/Chicken/Heilongjiang/G2/2003 NS基因序列的264~278处发生了15个核苷酸缺失;A/Goose/Jilin/W2/2004(H5N1)的NS1基因蛋白编码区的第652位碱基T/C突变而成为终止密码子,造成NS1蛋白的N-末端有13个氨基酸缺失.H5亚型禽流感病毒首次发生这种基因突变现象.研究发现不同基因型的H5N1亚型禽流感病毒在我国家禽中同时存在;再次证实了H9与H5亚型流感病毒基因间存在着广泛的遗传交换.因此,在严密控制H5N1高致病性禽流感流行的同时也要预防H9亚型禽流感,防止产生新的H5重组病毒株.