绵羊FGF5基因SNP的生物信息学分析

摘要

本文根据人和小鼠成纤维细胞生长因子5(FGF5)基因的同源序列设计引物对绵羊基因组进行PCR扩增,将扩增片段进行克隆和测序,并与人和小鼠的成纤维细胞生长因子5基因序列进行同源性比较,确定扩增的片断为绵羊的FGF5基因片断.采用PCR-SSCP技术分析了FGF5基因外显子在不同绵羊品种的多态性.结果表明:FGF5基因在P1引物扩增片段中存在PCR-SSCP多态性.经克隆测序分析,位于外显子1的引物1内存在G→T突变,该突变位点使编码的氨基酸发生A→S的改变;引物2中发生了碱基序列C→T的突变,这一突变位点没有引起编码氨基酸的改变,属于无义突变.对引起编码氨基酸的P1位点进一步进行了生物信息学分析,发现由于编码序列的改变引起蛋白质二级结构的变化,但没有引起功能位点和三级结构的变化.