甜杨葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因的电子克隆及其功能预测

摘要

以甜杨的无菌苗为材料，4 ℃低温处理24h，提取总RNA，采用电子克隆和RT-PCR相结合的方法首次从杨树中分离到一个新的葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因，其cDNA长1697bp，可编码510个氨基酸，cDNA序列及其推导的氨基酸序列均与其它植物G6PDH存在着较高的同源性，说明所获得的cDNA是甜杨G6PDH基因(PsG6PDH，AY445917)。同时，运用PCR扩增技术获得了甜杨G6PDH基因组序列，测序结果表明，基因组DNA长度为5040bp，含有15个外显子和14个内含子。Southern杂交结果表明，G6PDH基因在甜杨的基因组中可能是单拷贝或者低拷贝。通过网络服务器平台进行PsG6DH的功能预测，结果显示PsG6PDH为G6PDH的成员之一，含有NADP结合区和G6P结合区两个保守功能域，具有多个磷酸化位点和跨膜区域，但不含有信号肽，表明PsG6DH可能作为膜受体而起作用。另外，C6PDH的电子表达谱分析结果发现，G6PDH几乎可在植物中整株表达，在多种组织和不同发育过程均表达，并涉及各种逆境胁迫应答反应，这也在一定程度上说明了G6PDH在植物生长反育中的重要地位。