鸽源H5N1亚型禽流感病毒株的血凝素基因的克隆与序列分析

摘要

本研究对1株鸽源H5N1亚型禽流感病毒血凝素(HA)基因进行扩增、克隆和序列测定.结果表明,HA基因全长1707bp,含有一个完整的阅读框,起始密码子和终止密码子,编码568个氨基酸.在HA裂解位点附近有连续6个碱性氨基酸的插入,HA基因有7个糖基化位点;将该基因序列与已发表的同一亚型参考序列比较发现,该毒株与A/chicken/Jilin/9/2004(H5N1),A/chicken/HongKong/728/97(H5N1),A/HongKong/156/97(H5N1)和A/goose/Guangdong/1/96(H5N1)的核苷酸的同源率分别达98.1％、95.9％、96.3％和96.7％,氨基酸同源率分别达98.8％、95.8％、96.3％和96.8％.