4株虎源H5N1亚型高致病性禽流感病毒的遗传演化分析

摘要

2004年，从华北某动物园老虎体内分离和鉴定了4株H5N1亚型禽流感病毒(Avianinfluenzavirus，AIV)。致病指数测定结果表明，这4株病毒都是高致病性禽流感病毒(Highlypathogenicavianinfluenzavirus，HPAIV)。用H5N1亚型AIV的特异性引物，成功地扩增出这4株流感病毒的8个基因片段的全序列。与1996～2007年间的其它的H5N1亚型AIV毒株进行比对，HA基因序列分析显示：这4株流感病毒的HA基因的裂解位点处连接肽序列符合H5N1亚型HPAIV的特征：T1毒株裂解位点处连接肽的第3位发生R到G的突交；在受体结合位点(RBS)区域内，4株病毒在98、133、136、137、153、183、186、190、194、226和228位点的氨基酸很保守。在155位上,T2、T3、T4毒株是G,T1毒株为R。NA基因序列分析显示：4株病毒的NA茎部都具有20个氨基酸的缺失。NS基因序列比对表明：4株病毒在NS蛋白氨基酸的80～84位有“AIASS”五个氨基酸缺失。 基因遗传进化分析显示：4株病毒位于同一个基因群系，有很高的亲缘关系。与广东鸭源01GD毒株、湖北鸡源04HB毒株、韩国鸡源03Kor毒株具有核苷酸和氮基酸的最高同源性，亲缘关系最近，8段基因序列的遗传进化分析显示:4株毒株是重组病毒。 综上，4株病毒均为H5N1高致病性禽流感病毒并且有传播给人的可能.需加以防治。并且4株病毒位子同一分支，均为重组病毒，对于疫苗的开发研究有指导意义。

目录

文摘

英文文摘

论文说明：缩略词表

声明

一、综述部分

1禽流感的研究历史

2病原学

2.1病毒的分类和形态

2.2病毒的结构和各个蛋白的功能

2.3硫感病毒致病性的分子基础

2.4病毒的复制

2.5 HP AIV对动物的致病性

3人感染H5N1亚型AIV

3.1 AIV的人传播人

4实验室诊断

4.1病毒的分离和鉴定

4.2 RT-PCR

4.3血清学

5防治

5.1 预防

5.2控制

5.3抗病毒治疗

5.4疫苗接种

6本研究课题的目的意义

二、实验部分

实验1：4株虎源H5N1亚型禽流感病毒的分离和鉴定

1引言

2材料与方法

3结果

实验2：4株H5N 1亚型HP A I V的全基因序列测定和遗传演化分析

1引言

2材料

3方法

4 PCR结果

5 4株HSNl亚型HP AIV的基因序列分析

6 4株H5N1亚型HP AIV的遗传演化分析

7讨论

三、结论

参考文献

附录

致谢

攻读学位期间发表的论文