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七株猪2型圆环病毒ORF2基因的克隆及其序列分析

摘要

根据GenBank中猪圆环病毒2型(PCV2)ORF2基因序列,设计一对引物,通过PCR方法从采自不同地区的七份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合症(PMWS)的仔猪组织病料中分别扩增出PCV2的ORF2基因。将获得的ORF2基因片段分别克隆入pMD18-T载体,通过筛选获得重组质粒,分别命名为pMD-PCV2-HN01、pMD-PCV2-DY01、pMD-PCV2-HM01、pMD-PCV2-SDqd01、pMD-PCV2-SDqd02、pMD—PCV2-SDqd03、pMD-PCV2-PD01,并进行测序及序列分析。结果表明:HN01株ORF2基因全长为705bp,另六株ORF2基因全长均为702bp。七株分离株的ORF2基因核苷酸序列同源性较高,为94.0%~99.9%,氨基酸序列同源性达93.6%以上。七株与GenBank中登录的德国株和台湾株的核苷酸序列同源性较低,分别为91.7%~93.2%和89.0%~90.5%,而与丹麦、法国、中国株的核苷酸序列同源性较高,达94.0%以上,氨基酸序列同源性均达89.3%以上.

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