不同物种石细胞形成相关基因pal的生物信息学分析

摘要

植物石细胞具有分布多态性和形态多态性,是植物类药材显微鉴别的重要特征。石细胞是由通过细胞壁次生加厚木质素沉积而形成的,木质素的合成、转运和沉积与石细胞的发育有密切的关系。研究发现,多种因素会影响木质素的形成而影响石细胞的含量、大小和分布,因此常常干扰药材的鉴定。苯丙氨酸解氨酶(PAL)是木质素代谢的第一个限速酶,对于石细胞的形成发挥调控作用。所以我们对NCBI数据库中注册的11种植物物种的pal完整编码序列,利用DNAstar等相关软件对比Pal的基因长度多样性、开放阅读框的序列长度多样性、起始位点、终止位点和终止密码子的多样性,并利用该软件对比氨基酸序列同源性,建立各物种之间的系统进化树,分析不同物种的pal 基因在进化过程中产生的多样性,为pal基因用于植物药材鉴定提供基础资料和研究方法。