荧蒽诱导下红球菌BAP-1的差异表达蛋白研究

摘要

利用iTRAQ技术结合LC-MS/MS对荧蒽不同诱导时间的红球菌BAP-1差异蛋白进行功能聚类以及生物信息学分析,以研究荧蒽高效降解菌的蛋白功能调控机理.本研究共鉴定到796个差异蛋白(Fold change＞2,Q-value≤0.05),其中表达上调613个,下调183个.三个比对组(3d/1d,6d/1d和8d/1d)共同差异表达蛋白为111个(上调56个,下调55个).COG功能分析发现绝大部分差异蛋白参与到能量产生与转化,氨基酸转运与代谢,以及翻译,核糖体结构与生物合成过程.GO富集分析发现大部分蛋白参与到生物过程中的氧化还原反应,能量产生和代谢过程,在分子功能中主要参与氧化还原活性,在细胞组件中更多蛋白参与到高分子配合物和细胞器部分.pathway富集分析发现参与不同环境中的微生物代谢通路的蛋白数量最多,磷酸肌醇代谢富集因子较高.上调关键蛋白有细胞色素C,三磷酸腺苷合成酶,二磷酸核苷等激酶,还有一些结合蛋白,脱氢酶,核糖体蛋白和趋药性蛋白等;下调显著的是5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸-同型半胱氨酸甲基转移酶.这些蛋白共同组成蛋白互作网络调控荧蒽降解菌的一系列生命活动.