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Transcriptome analysis method, disease determination method, computer program, storage medium, and analysis apparatus

机译:转录组分析方法,疾病确定方法,计算机程序,存储介质和分析装置

摘要

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for calculating a principal component using an analyzer dealing with data comprising many measurement items.SOLUTION: There is disclosed a method for calculating a principal component from data matrix using an analyzer. The analyzer conducts scaling by dividing the principal component by the square root of the number of samples used for calculation of the principal component or the number of measurement items. The analyzer also selects a sample in which the expression level has changed at a predetermined threshold value from the scaled principal component. It is possible herewith to deal with data in which the measurement items are different in part and the number thereof is large.
机译:解决的问题:提供一种使用分析器来处理包含许多测量项目的数据的主分量的方法。解决方案:公开了一种使用分析器从数据矩阵中计算主分量的方法。分析仪通过将主成分除以用于计算主成分的样本数或测量项目数的平方根来进行缩放。分析器还从缩放后的主成分中选择表达水平以预定阈值变化的样品。由此可以处理其中测量项目部分不同并且数量众多的数据。

著录项

  • 公开/公告号JP5854346B2

    专利类型

  • 公开/公告日2016-02-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 公立大学法人秋田県立大学;

    申请/专利号JP20100214256

  • 发明设计人 小西 智一;

    申请日2010-09-24

  • 分类号G06F19/24;C12N15/09;C12Q1/06;

  • 国家 JP

  • 入库时间 2022-08-21 14:40:02

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