一种基于蛋白质-域异构网络的关键蛋白预测方法

摘要

本发明根据PageRank算法，设计了一种基于异构蛋白质域网络的基本蛋白质预测方法。本发明先将加权PPI网络、域‑域网络和初始蛋白质域网络三种网络结合起来，构建一个新的蛋白质‑域异构网络。其中，这三种网络分别根据基因表达数据、原始PPI网络以及已知的蛋白质‑域关联关系网络建立起来的。然后根据提取的每个蛋白质的功能特征和拓扑特征计算出每个蛋白质和域的初始分数。接下来，在新构建的蛋白质‑域异构网络的基础上，根据蛋白质和域的初始分数进一步构建新的分配率网络。最后，在构建的分配率网络的基础上，本发明设计了一种改进的PageRank算法来预测关键蛋白，并且预测的精度得到了很大的提高。