本发明属于分子生物学及遗传育种学技术领域,涉及与芝麻开花期主效QTL位点紧密连锁的分子标记HSRC3911及其应用。本发明利用BC1群体和BC1F2家系在芝麻LG08连锁群定位了一个控制开花期的主效QTL位点,在不同环境中可解释表型变异的41.50%~57.55%,命名为qFT_LG08,并开发出与qFT_LG08紧密连锁的SSR分子标记,该分子标记为HSRC3911,其核苷酸序列如SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示,其引物序列为:HSRC3911F:5'‑GTTCTAATCAGCTATCGCATTTCTT‑3',HSRC3911R:5'‑ACACACGCACATACACCACGCACAC‑3'。通过本发明分子标记的应用,可以有效预测芝麻遗传分离材料开花期长短,通过分子标记辅助选择,可以在低世代对育种材料开花期进行快速、准确、高效地筛选。
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