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一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法

摘要

本发明公开了一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法,包括:S1、根据已知的LncRNA‑环境因素关联关系网络的邻接矩阵,分别计算出LncRNA的高斯相互作用属性核相似矩阵KL和环境因素的高斯相互作用属性核相似矩阵KE;S2、把KL和KE通过拉普拉斯算子进行归一化;S3、在LncRNA空间和环境因素空间中分别定义成本函数,通过最小化该成本函数,分别得到LncRNA空间和环境因素空间的最优分类器;S4、将得到的两种最优分类器转化为统一空间的分类器,用于计算LncRNA‑环境因素关联关系的概率,根据概率对LncRNA‑环境因素关联关系进行排名,概率值越高说明该LncRNA‑环境因素的关联关系越强。所述方法有效解决了生物实验方法的盲目性、成本高问题,对生物学家的实验研究起到了指导的作用。

著录项

  • 公开/公告号CN108427865B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-04-22

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 华南理工大学;

    申请/专利号CN201810209311.7

  • 发明设计人 周杰;徐展良;

    申请日2018-03-14

  • 分类号G16B40/20;G16B50/30;G16B20/00;

  • 代理机构广州市华学知识产权代理有限公司;

  • 代理人李斌

  • 地址 510640 广东省广州市天河区五山路381号

  • 入库时间 2022-08-23 13:31:57

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