一种应用甘蔗着丝粒特异重复序列开展染色体准确计数的新方法

摘要

本发明涉及生物信息学与分子细胞遗传学技术领域，尤其涉及一种应用甘蔗着丝粒特异重复序列开展染色体准确计数的新方法，包括以下步骤：步骤一、获取甘蔗属着丝粒特异重复序列；步骤二、分离甘蔗属着丝粒重复序列并开展计数分析；本发明利用甘蔗属着丝粒特异组蛋白的染色质免疫共沉淀与高通量测序技术相结合(ChIP‑Seq)的方法得到了甘蔗着丝粒区DNA序列；通过比较分析，筛选出在不同甘蔗种着丝粒区具有的重复序列；根据该序列设计引物，扩增、标记后用于有丝分裂中期荧光原位杂交(FISH)，进行染色体计数。结果显示，这一序列在不同甘蔗种的全部染色体的着丝粒区域产生特异且清晰明亮的信号；通过统计着丝粒信号数目可快速、准确获得不同材料染色体数目。