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一种基于目标区域测序的单个外显子拷贝数变异预测方法

摘要

本发明涉及一种基于目标区域测序的单个外显子拷贝数变异预测方法,包括和测序数据处理和拷贝数变异预测2个步骤,其中拷贝数变异预测步骤包括统计覆盖到目标区域的测序序列总数目和碱基总数目,确定对照外显子区域,标准化每个对照样本和实验样本的待分析外显子区域覆盖度,计算对照样本中待分析外显子区域标准化后的覆盖度的平均值、标准差和变异系数,预测待分析外显子区域拷贝数变化步骤。本发明不用基于全基因组测序,直接利用外显子水平的覆盖度信息进行分析外显子水平的拷贝数变异,分析方法简单,不经过复杂的GC校正和建模。

著录项

  • 公开/公告号CN108920899B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-02-08

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 杭州迈迪科生物科技有限公司;

    申请/专利号CN201810591504.3

  • 发明设计人 朱忠旭;周文莉;杨克勤;吕远栋;

    申请日2018-06-10

  • 分类号G16B30/10(20190101);G16B20/20(20190101);

  • 代理机构11435 北京志霖恒远知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人奚丽萍

  • 地址 311305 浙江省杭州市临安区青山湖科技城创业街199号3楼

  • 入库时间 2022-08-23 13:05:22

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