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确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能的方法

摘要

本发明公开了确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能的方法,其包括以下步骤:分别获得同一林木个体的维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA;分别针对所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA,进行cDNA文库构建及测序;基于测序结果进行lncRNA预测和注释;基于所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的lncRNA表达量,进行组织特异性表达分析,以便确定具有组织特异性的lncRNA;将所述具有组织特异性的lncRNA进行序列元件motif预测,以便确定具有组织特异性的lncRNA的motif;以及对具有组织特异性的lncRNA的motif进行功能分析。利用该方法能够有效确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能,对于进一步挖掘lncRNA在林木次生生长过程中的调控作用意义重大。

著录项

  • 公开/公告号CN108517367B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-10-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京林业大学;

    申请/专利号CN201710230163.2

  • 发明设计人 张德强;周大凌;杜庆章;

    申请日2017-04-10

  • 分类号C12Q1/6895(20180101);

  • 代理机构11201 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人赵天月

  • 地址 100083 北京市海淀区清华东路35号

  • 入库时间 2022-08-23 12:40:41

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