基于网络拓扑参数的癌症生物分子标志物筛选方法及系统

摘要

本发明公开了一种基于网络拓扑参数的癌症生物分子标志物筛选方法及系统，所述方法包括：获取人类基因间相互作用网络和基因芯片表达数据，整合得到基于基因表达数据的基因间相互作用网络；构建疾病状态和对照状态基因间相互作用网络；计算得到疾病状态和对照状态基因间相互作用网络之间的网络拓扑参数差异基因，基于网络参数差异基因得到网络拓扑参数差异变化网络；对网络拓扑参数差异网络进行网络模块挖掘；对得到的差异网络模块进行特征选择，得到各模块中对正常与疾病具有辨别性的基因；检测各模块中选择的基因对疾病的分类效果，根据分类效果筛选差异网络模块作为生物分子标志物候选。本发明提供了一种新的基于组学数据的复杂疾病生物标志物识别方法，实验证明具有一定的准确性和有效性。