一种解析植物内生细菌菌群的方法

摘要

本发明公开了一种解析植物内生细菌菌群的方法。本发明提供了用于解析植物内生细菌菌群的引物对，其靶序列为细菌16SrDNA的V3‑V4区的全长或部分；且所述引物对中的一条引物3’末端最后一个碱基与植物线粒体18SrDNA有差异，且该引物全长与植物线粒体18SrDNA的差异位点大于等于3个；另一条引物3’末端最后一个碱基与植物叶绿体16S rDNA有差异，且该引物全长与植物线粒体18SrDNA的差异位点大于等于3个。本发明设计了一对引物322F‑1和796R，选择了具有热启动活性且没有3’→5’外切酶校正活性的DNA聚合酶，共同实现了同时避开宿主植物叶绿体16S rDNA和线粒体18S rDNA两种序列污染的目的，从而获得了纯的细菌菌群16S扩增子文库。