一种不依赖数据库搜索的蛋白质生物标志物鉴定方法

摘要

本发明公开了一种不依赖数据库搜索的蛋白质生物标志物鉴定方法，其步骤包括：1)提取训练数据集中每一个质谱原始文件中的离子流色谱峰；2)对离子流色谱峰列表进行预处理，将共同检测到的质荷比对应的信号强度值的平均值和标准差，以点(平均值，标准差)的形式顺序排列成特征向量；3)采用深度学习技术，以用预处理后的离子流色谱峰列表为训练集，构建实验组与对照组样本分类模型；4)用训练好的分类模型对待鉴定实验数据进行类别鉴定，区分其属于实验组还是对照组；5)确认鉴定结果准确率符合要求后，输出分类模型所采用的关键特征向量；6)利用靶向蛋白质组学技术确定所述关键特征向量对应的肽段及蛋白质序列，作为生物标志物。