一种基于PFGE分析菌株之间的差异基因的方法

摘要

本发明公开了一种基于PFGE分析微生物菌株之间的差异基因的方法，采用限制性内切酶对样品基因组进行酶切，酶切后的DNA利用PFGE技术进行分离，对差异条带进行测序比对，得到的序列即为物种间的差异基因。本发明采用脉冲场凝胶电泳系统（PFGE，Pulsed Field Gel Electrophoresis）来寻找不同菌株之间的差异基因，PFGE技术在寻找差异基因方面表现出更高的优越性，此方法操作简单，可行性高，价格低廉。采用本发明所述方法，成功发现了属于同一种属不同亚种的菌株在基因水平上的不同，确立了PFGE技术在寻找同种菌株基因片段差异研究的可行性。